玉山國家公園園區因地形特殊，海拔高差達 3,600 公尺，除峽谷、斷崖、風口等特殊地形，也具有暖、溫、寒 3 型的多變氣候，多樣的棲地蘊涵繁盛的植物種類，其面積雖僅為臺灣的 3 %，卻包含了臺灣半數以上的原生植物，在地理位置和海拔變化的交互作用下，不但具有亞熱帶植被，亦可見北國的植物景象。
園區植物分布可劃分為 5 大植群帶，分別為高山植群帶、冷杉林帶、鐵杉雲杉林帶、櫟林帶、楠櫧林帶；櫟林帶包含在臺灣山區盛行雲霧帶之範圍，而雲霧最濃之地區則常出現臺灣特有之檜木林相，該林帶涵蓋了園區大部分。 110 年統計顯示全園區植物種類共有單子葉植物計 475 種、雙子葉植物 1,580 種、裸子植物 27 種、蕨類植物 455 種、苔蘚植物 231 種、菌類148 種，顯示本園區不同的森林群系孕育出複雜而豐富的植物。
高山植群帶
本植群帶主要分布在 3,600 公尺以上，因植物組成及環境因子之不同，可分為寒原植群型及玉山圓柏林型等。
杜鵑
玉山佛甲草
玉山圓柏
玉山圓柏
冷杉林帶(針葉林)
臺灣冷杉
鐵杉雲杉林帶(針葉林)
鐵杉
二葉松
櫟林帶
紅檜
楠櫧林帶(常綠闊葉林)
| 植群帶 | 氣候帶 | 海拔高度(公尺) | 主要代表植物 |
|---|---|---|---|
| 高山植群 | 亞寒帶 | >3,600 | 玉山圓柏、玉山杜鵑、高山草本植物 |
| 冷杉林帶 | 冷溫帶 | 3,100-3,600 | 臺灣冷杉 |
| 鐵杉雲杉林帶 | 涼溫帶 | 2,500-3,100 | 臺灣鐵杉、臺灣華山松、臺灣二葉松、臺灣雲杉、高山櫟 |
| 櫟林帶 | 溫帶 | 1,500-2,500 | 紅檜、臺灣扁柏、臺灣杉、巒大杉、南方紅豆杉、臺灣紅榨槭、青楓、尖葉槭、野核桃、阿里山榆等 |
| 楠櫧林帶 | 亞熱帶 | 500-1,500 | 臺灣黃杉、臺灣肖楠、假長葉楠、大葉楠、臺灣雅楠等 |
玉山龍膽
紅毛杜鵑
雪山翻白草
