一、調查緣起
本（104）年度水質檢測工作，則依照92年度委託之「玉山國家公園氣象資料蒐集與水質監測調查」報告所建立的方法與流程，持續採樣與檢測水質，除可持續建立基礎資料之外，更有利於資料的比較分析。
本年度水質監測調查成果，將登錄於本處97年度所建立的氣象與水質資訊網站系統，除提供民眾參考與分析之用，亦增進民眾對本處園區自然環境資源之保育及永續有效利用之認知與肯定。
本年度水質分析工作按照過往方式辦理採樣與檢測分析，再與歷年水質資料比較瞭解園區飲用水之水源及天池湖泊水之水質狀況。
二、調查方法與過程
本年度園區水質檢測，計採取水樣地點共計10點（20次），分豐枯兩季節採取梅山、南安、塔塔加、排雲之管理站、東埔一鄰的飲用水水源及排雲山莊溪澗水、楠梓仙溪河川水、天池湖泊、沙里仙溪、楠梓仙溪，再綜合分析歷年的水質檢測資料。
水質檢驗項目本年度檢測項目，則採重點項目進行檢測包括：（一）在飲用水水源部分，在飲用水水源部分，包括水溫、pH值、大腸桿菌群、氨氮、溶氧量、懸浮固體、生化需氧量（BOD）等7項，增加化學需氧量（COD）、總有機碳等2項。（二）河川水部分，河川水檢測項目包括水溫、pH值、大腸桿菌群、懸浮固體、生化需氧量、氨氮、溶氧量、總磷等8項。（三）天池湖泊水，本年度進行檢測項目包括水溫、pH值、大腸桿菌群、懸浮固體、生化需氧量、氨氮、溶氧量等7項；再加測總磷、透明度以及葉綠素等3項，以估計水質指標或優養程度。水體之採樣方法、保存方式、檢測方法則依據行政院環保署所公告之規定辦理。而園區各項水體水質的狀況則以環保署所公告的「飲用水水質標準」、「飲用水水源水質標準」及「地面水體分類及水質標準」，進行水質檢測項目之結果分析。另外，園區河川與天池湖泊的污染程度以河川污染指標（RPI） 檢定，而天池湖泊的水質以卡爾森優養指數（CTSI）分析優養化程度。
三、重要發現
本（104）年度水質各項目的檢測結果，塔塔加管理站、梅山管理站、排雲山莊、排雲管理站之枯水期，符合「飲用水水源水質標準」（指大腸桿菌群值、濁度及氨氮值等3項）。歷年資料分析，排雲管理站、塔塔加管理站、排雲山莊大都符合「飲用水水源水質標準」，但排雲山莊100年度及101年度豐水期的大腸桿菌群值為150及170 CFU/100mL，超過以往的數值，本年度豐水期大腸桿菌群值為2 CFU/100mL，由100年度之前該山莊水源的大腸桿菌群值大都在10 CFU/100mL以下（除98年枯水期為30 CFU/100mL之外），顯示100~101年度這2年度的豐水期間可能因受山莊整建工程之影響，而本年度雖符合標準值，但仍需持續監測以瞭解是否是受登山遊客影響。梅山、南安2管理站之水源，本年度則因大腸桿菌群值，大都超過該水質標準，不符合「飲用水水源水質標準」，而東埔一鄰水源，本年度枯水期大腸桿菌群值則皆不符合該標準。歷年來資料顯示，該三點大都不符合該水質標準，但不管是否符合上述二水質標準，建議煮沸後飲用。
本年度河川水部分，楠梓仙溪屬於「地面水體分類及水質標準」乙類水體、沙里仙溪屬於乙類水體、拉庫拉庫溪屬於丙類水體。天池湖泊水屬於丙類水體。
天池湖泊本年度的水質由卡爾森指數計算顯示，在豐水期平均數值為86.66，枯水期平均數值為71.68，皆處於優養化狀態（詳見表4及表5）。此外，在豐枯水期之總磷值分別為8.10、0.485mg/L，磷濃度大於0.02 mg/L，為優養狀態（Eu-trophe），本年度的總磷值比歷年高出相當多，是處於異常狀態。天池湖泊歷年水質之卡爾森指數，顯示皆處於優養化狀態。
四、主要建議事項
根據調查發現，本報告提出下列具體建議。以下分別從立即可行的建議及長期性建議加以列舉：
立即可行之建議
考量水質長期監測與分析，建議應針對水質必須檢測項目持續進行檢測，以瞭解園區水質變化情形，並有利於長期水質監測之比較。
長期性建議
在河川與湖泊之水質檢測部分，建議增加檢測硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、總凱氏氮、總氮、總磷、六價鉻、砷、汞、硒、錳、銀等項目，以提供更多的數據，與水體分類水質標準進行比較與做為水體水質標準符合程度之評估參考，並能充分描述園區水體的水質狀況。