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玉山國家公園內全區共有一百九十一種鳥類、五十八種哺乳類、十八種爬蟲類、十三種兩棲類、八百二十六種昆蟲、十二種淡水魚類、二十九種貝殼類。以下列舉二十四種哺乳類動物資料,其餘詳細內容請參玉山的動物。
哺乳類
 
鼴鼠科
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尖鼠科
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鼠科
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松鼠科
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免科
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鯪鯉科
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獼猴科
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貓科
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靈貓科
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貂科
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獴科
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熊科
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牛科
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鹿科
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豬科
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葉鼻蝠科
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蹄鼻蝠科
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蝙蝠科
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